Ο Δημήτρης Κουναλάκης αποφοίτησε από την Ιατρική και έλαβε την ειδικότητα της Γενικής Ιατρικής. Η διατριβή του είχε αντικείμενο τον Ηλεκτρονικό Φάκελο Ασθενή στην Πρωτοβάθμια Φροντίδα Υγείας και στην κωδικοποίηση νοσημάτων ICPC2. Ολοκλήρωσε το μεταπτυχιακό «Διοίκηση Μονάδων Υγείας ΕΣΥ». Στις μεταπτυχιακές του εκπαιδεύσεις περιλαμβάνονται το ετήσιο μετεκπαιδευτικό πρόγραμμα του ΕΚΑΒ στην Επείγουσα Ιατρική, η μετεκπαίδευση στο Σακχαρώδη Διαβήτη, το Advanced Trauma Life Support. Έχει εργαστεί έξι χρόνια ως Επιμελητής ΕΣΥ στο Κέντρο Υγείας Ανωγείων, και το 2010 έως σήμερα εργάζεται ως ιατρός στον ιδιωτικό τομέα. Είναι Ειδικός Γραμματέας Υπηρεσιών Υγείας στον Ελληνικό Σύνδεσμο Πληροφορικής Υγείας και μέλος του ΔΣ του Ελληνικού Δικτύου Διαβήτη στην ΠΦΥ, ενώ έχει περάσει και από άλλες ανάλογες θέσεις στο παρελθόν. Έχει διατελέσει διδάσκαλος/εκπαιδευτής σε φοιτητές ιατρικής, ιατρούς, επαγγελματίες υγείας.
Το ερευνητικό του αντικείμενο είναι οι κωδικοποιήσεις της υγείας και η πληροφορική στην υγεία, και έχει συμμετάσχει σε ερευνητικά προγράμματα με αυτά τα αντικείμενα. Γνωρίζει να προγραμματίζει σε Delphi, C, PHP συντηρώντας ένα λογισμικό ηλεκτρονικού φακέλου που χρησιμοποιούν αρκετοί ιατροί μέσα από την εταιρεία MedSite. Έχει μεταφράσει στα ελληνικά τις κωδικοποιήσεις ICPC2, κεφάλαια της ICD10, ATC, ιατρικά ερωτηματολόγια και εκπροσωπεί την Ελλάδα στην Επιτροπή Ταξινομήσεων της WONCA. H πιο πρόσφατη συμμετοχή του είναι στο έργο της διασυνοριακής υγείας της ΗΔΙΚΑ και στην ομάδα εργασίας του Εθνικού Πλαισίου Διαλειτουργικότητας. Τον ελεύθερο χρόνο του τον αφιερώνει στη σύζυγο και τα τέσσερα παιδιά του καθώς σε ιατρικά φόρουμ που είναι διαχειριστής.